埃博拉宿主內(nèi)進(jìn)化研究獲突破

健康報(bào)訊 （通訊員王 燕 記者孫 夢(mèng)）由中國(guó)科學(xué)院微生物研究所、*軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院等單位科研人員合作開展的埃博拉病毒宿主內(nèi)進(jìn)化研究取得重大突破。該研究系統(tǒng)地揭示了埃博拉病毒在宿主內(nèi)的進(jìn)化模式，重新闡明了病毒基因中重要變異位點(diǎn)在“病毒—宿主”相互影響中的作用，為抗病毒藥物研發(fā)設(shè)計(jì)藥物靶標(biāo)提供了新依據(jù)。該研究論文近日在線發(fā)表在《自然·微生物學(xué)》雜志上。

該論文并列*作者、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所陳晨博士介紹，研究團(tuán)隊(duì)采用擴(kuò)增子深度測(cè)序，并為此開發(fā)了一套全新的生物信息學(xué)分析流程，通過對(duì)135個(gè)樣本的測(cè)定，*次發(fā)現(xiàn)了埃博拉病毒在宿主內(nèi)進(jìn)化過程中曾經(jīng)產(chǎn)生的710個(gè)單核苷酸變異位點(diǎn)。

“如果說(shuō)人體內(nèi)有10000個(gè)埃博拉病毒，運(yùn)用傳統(tǒng)的分析研究方法，只有當(dāng)體內(nèi)6000個(gè)甚至8000個(gè)病毒發(fā)生變化時(shí)才能監(jiān)測(cè)到病毒變化，而通過此次設(shè)計(jì)的生物信息學(xué)分析流程，只要人體內(nèi)2個(gè)～5個(gè)病毒發(fā)生變化就能監(jiān)測(cè)到。”陳晨介紹，借助方法學(xué)的突破，可以在臨床上更早、更地發(fā)現(xiàn)病毒變異，為后期用藥提供指導(dǎo)。同時(shí)，研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)，病毒VP40基因受到了強(qiáng)烈的負(fù)選擇，這為抗病毒藥物設(shè)計(jì)提供了新靶點(diǎn)。

中國(guó)科學(xué)院微生物研究所劉文軍研究員認(rèn)為，本研究“從個(gè)體內(nèi)種群變異這一嶄新角度，解讀了病毒的進(jìn)化規(guī)律，是宿主內(nèi)進(jìn)化這一病毒學(xué)前沿領(lǐng)域的重大突破”。